根据原作动画《花仙子》（东映动画）改编。立志成为调香师的学徒露米在归家途中遭遇黑雾袭击，危难间在自称是花星使者的黑猫的指引下，唤醒了祖先留下的古董花钥匙的力量，并变身成为花仙子。由于七色花被黑暗魔法侵蚀而凋零，七片花瓣散落在花都镇各处，导致异象频出蚕食人们的心智。为了花都镇的安危，露米作为继承了花仙血统的后人，肩负起净化并收集七片花瓣的使命，运用花香魔法驱散人们心中的黑暗，开启一场魔法少女的成长之旅。而在这场冒险中，露米却遭到来自另一名神秘花仙子的攻击，而自己身边的这只黑猫竟也有着意想不到的身份.....